Después de la Segunda Guerra Mundial, el Wigan Athletic adoptó sus colores azul y blanco actuales. Después de la Segunda Guerra Mundial, el club experimentó una fase de declive gradual, perdiendo su lugar en la First Division en 1952. Regresó inmediatamente a la máxima categoría, pero volvió a descender tres temporadas después. Descendido por primera vez en 1952, permaneció en la Segunda División durante una temporada y luego se mantuvo en la máxima categoría hasta 1956, llegando al mismo tiempo a la final de la FA Cup en cuatro ocasiones (sin ganarla).